分子模拟定义及方法 将一定数量的分子输入计算机内进行分子微观结构的测定和宏观性质的计算。按照获得微观态的方法不同,分子模拟可以分为: 1.Monte Carlo蒙特卡罗方法,MC:1.构型平均,不包含动力学部分;2....
分子模拟定义及方法 将一定数量的分子输入计算机内进行分子微观结构的测定和宏观性质的计算。按照获得微观态的方法不同,分子模拟可以分为: 1.Monte Carlo蒙特卡罗方法,MC:1.构型平均,不包含动力学部分;2....
分子模拟(Molecular Modeling) 泛指用于模拟分子或分子体系性质的方法。 计算化学研究的领域: 预测分子结构 储存和搜索各种化学信息(chemical databases) 确定结构和活性的关系(QSPR QSAR)
标签: 分子沉积模拟
主要介绍了计算机在材料科学中的一个练习题,功能是模拟气化后分子沉积
蒙特卡洛 未完成的蒙特卡洛代码,用于模拟分子。 用谐波键和角度模拟聚合物 去做 Lennard-Jones和库仑相互作用 隐式溶剂(以其介电常数输入模型) 组态偏差蒙特卡洛 多得多...
简单的代码可以模拟分子几何文件中的电子衍射信号。 该代码适用于SLAC国家加速器实验室( )的MeV超快电子衍射设备的用户,有关详细信息,请参见Diffraction.py和Example的注释。 .py。 Diffraction.py包含类和函数...
标签: Qt
在绘图区显示若干个不同颜色的圆点,通过定时器刷新圆点的位置
计算机分子模拟技术在药物设计中的应用1.刘景陶2.刘映雪(1. 015000河套学院2. 015000内蒙古巴彦淖尔市医院)摘要:通过计算机模拟手段进行分子对接、药物筛选、先导物的优化、定量构效关系和药效团模型等药物设计方法...
该楼层疑似违规已被系统折叠隐藏此楼查看此楼“GROMACS分子动力学模拟技术与应用”课 程 内 容分子动力学模拟基础 1 分子模拟入门理论——对分子动力学模拟原理介绍1.1统计力学基本假设1.2统计概率1.3配分函数的定义...
陈教授经典之作,从事分子模拟的必看
分子动力学模拟交流***: 668223348 (王老师邀请)Gromacs和Amber的分子动力学模拟技术与应用课程在北京举办。课程一GROMACS分子动力学模拟课程GROMACS基础 1 分子模拟入门理论——对分子动力学模拟原理游刃有余...
lammps分子动力学模拟水分子,可以模拟任意数量级的水分子团簇,进行水分子的动力学研究。
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分子模拟动力学模拟软件Genesis.zip 日本分子模拟动力学模拟软件Genesis的安装包和测试包,以及安装及使用手册
分子动力学模拟软件lammps编程实例。
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分子建模:分子模拟
%Brownian motion 布朗运动 clc,clear,close all; %清除命令,清空工作区,关闭所有窗口 n=20; s=0.02; x = rand(n,1)-0.5; y = rand(n,1)-0.5;...h = plot(x,y,'.', 'MarkerSize',18);...% set(h,'E...
这里我们需要去修改力场的 ,因为小分子的原子类型是不包括在本身的力场中的,我们需要对力场的原子类型进行更改,找到生成protein的力场问题重新复制一份,将小分子itp文件中的 atomtype 下的原子类型复制到 力场...
分子模拟与设计基本理论的课件,具体包含Force Fields,Solvation Models,Molecular Dynamics,Advanced Topics on MD,Molecular Design。文件长达90多页,内容较为详细。
提出了一种模拟准分子激光光能量分布的方法。通过使用Matlab软件分析实际拍摄到的准分子激光光能量分布彩色图像并提取相关信息进行计算,使用光学软件Zemax模拟出实际的准分子激光的光能量分布。实际准分子光源光斑...
分子模拟(Molecular Simulation) 利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而计算出合理的...
分子动力学模拟的简化版。PDF文件中包含了伪代码。
动力学模拟gromacs(绝对详细)动力学模拟实验 一、选题背景: 材料:凝集素样氧化型低密度脂蛋白受体1(LOX-1) 两条链的序列: >gipdb|1YPU|A Chain A, Human Oxidized Low Density Lipoprotein Receptor Lox-1 C2 ...
摘要:传统的药物分子设计方法不仅耗时耗力,而且有一定的...各种模拟方法不断应用到药物分子设计中,如定量结构活性关系,分子对接和分子动力学模拟等.本学位论文运用定量结构活性关系对HIV-1(Human Immunodeficiency...