ovito软件是一个后处理软件,我用它来做lammps的简单后处理,
分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件(四): Lindemann Index。
LAMMPS 的的19个典型案例,包括in文件、分析原理和matlab后处理等,适用于新手的入门教程。
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通过读取LAMMPS输出文件、提取原子坐标、计算物理量和数据可视化,我们可以对分子模拟的结果进行深入分析。同时,Matlab还提供了灵活的自定义功能,使我们能够根据具体需求实现特定的功能。在LAMMPS模拟中,通常会...
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记录一下检索到一篇分子动力学模拟数据后处理的软件。感谢论文的原作者!文章题目:MDSuite: comprehensive post‑processing tool for particle simulations文章链接:https://doi.org/10.1186/s13321-023-00687-y...
本文将介绍一些LAMMPS后处理的常见任务以及如何使用Matlab进行编程来完成这些任务。本文介绍了LAMMPS后处理的常见任务,并演示了如何使用Matlab进行编程来完成这些任务。通过读取数据、可视化原子轨迹以及计算和分析...
LAMMPS的后处理界面有几个重要的区分。 首先,LAMMPS的后处理界面可以用于从模拟中提取和分析各种不同类型的数据。这些数据包括粒子的坐标、速度、能量、压力和动力学性质等。后处理界面可以帮助用户从LAMMPS的输出...
通过这些后处理方法,可以更深入地了解原子模拟的结果,并得到相关物理参数的信息。在分子动力学模拟中,LAMMPS是一个常用的软件包,用于模拟原子尺度系统的运动和相互作用。在导出的原子坐标文件中,每一行代表一个...
以下是一个简单的LAMMPS后处理脚本,用于计算hydro_stress和von Mises stress: ``` # LAMMPS后处理脚本 # 计算hydro_stress和von Mises stress # 导入必要的Python库 import numpy as np import sys # 打开...
在lammps晶体力学模拟中,位错分析(DXA)是常用的一种后处理分析方法。 lammps模拟结果导入到ovito,添加“Dislocation analysis”即可显示位错信息。 关于ovito DXA的使用方法,网上有很多教程,可搜索查看。 本文...
https://icme.hpc.msstate.edu/mediawiki/index.php/LAMMPS_tutorials.html
通过将粒子坐标划分到三维空间网格中,我们可以进行粒子数量、密度和温度等属性的统计分析,并通过可视化展示结果。上述代码中,我们首先定义了空间网格的边界,即粒子坐标的...LAMMPS后处理——MATLAB空间网格划分。
这就是使用Matlab进行LAMMPS后处理,构建维云图-接触角的基本步骤。根据您的需求,您可以进一步扩展和修改代码,以满足特定的分析要求。在实际应用中,您可能还需要考虑数据的平滑处理、误差分析和其他相关因素,以...
标签: lammps
lammps计算应力 lammps计算的应力有两种: 1.体系整体的应力状态 通过在thermo_style custom里加上pxx pyy pzz pxy pxz pyz字段可将给定时间步(由thermo N命令所指定)的体系应力值输出,再求时间平均即可(实际上...