python和r语言生物信息学_R语言和Python哪个适合生物信息学?-程序员宅基地

技术标签: python和r语言生物信息学  

生物信息学中Python,R 和Perl 之争很久了,Perl,R,Python在生物信息学中分别扮演着怎样的角色?​www.zhihu.com

不过Perl慢慢走出主战场,就不谈了,Python和R无疑都是需要的。这里我们看看Python和R在生物信息学中的地位,初学者怎么学?

先比较这两种语言的特点,这个链接很不错:R Programming vs Python | Explore the Top 10 Amazing Differences​www.educba.com

该文总结了从数据科学的角度看R和Python的不同,结合我自己的经验,主要的归纳成以下几点:

1,R偏重探索性研究;Python更有利于开发。

2,R统计功能强大,非常多的这方面的库;Python适合通用程序接口,很好的胶合各种组件。

3,R的数据表的格式直接;Python的字符串、序列的处理要方便。

4,R的入门编程范式是使用函数;Python的入门编程范式是设计流程。而进一步进行对象程序设计,R的难度比Python要困难。所以R对没有编程经验的人入手会快但提高很难,而Python则有更好的学习曲线。

5,R的本地数据分析方式方便,Python更容易搭建数据库和网络应用。

6,R的代码可读性不如Python。

结合生物信息学的特点,针对每个人的背景不同可以选择不同的学习路线:

1,没有编程背景的人,在数据项目中需要处理时,推荐从R开始进行数据探索,简单的表格处理和绘图。把文本处理和复杂程序流程设计交给专业人士,团队协作。

2,没有项目压力的学生,建议从Python入手,步步为营,先把一门语言的基础打好。然后根据进一步需要如果选择探索性科研方向,再学习R,以及如何从Python中调用R函数等高级功能;或者如果需要偏向算法,深入学习C++/java编程,或是偏向数据库开发学习SQL、NoSQL等等。

门门稀松不如一门精通,沉下心来就会成功。

版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接:https://blog.csdn.net/weixin_39655981/article/details/110983334

智能推荐

Docker 快速上手学习入门教程_docker菜鸟教程-程序员宅基地

文章浏览阅读2.5w次,点赞6次,收藏50次。官方解释是,docker 容器是机器上的沙盒进程,它与主机上的所有其他进程隔离。所以容器只是操作系统中被隔离开来的一个进程,所谓的容器化,其实也只是对操作系统进行欺骗的一种语法糖。_docker菜鸟教程

电脑技巧:Windows系统原版纯净软件必备的两个网站_msdn我告诉你-程序员宅基地

文章浏览阅读5.7k次,点赞3次,收藏14次。该如何避免的,今天小编给大家推荐两个下载Windows系统官方软件的资源网站,可以杜绝软件捆绑等行为。该站提供了丰富的Windows官方技术资源,比较重要的有MSDN技术资源文档库、官方工具和资源、应用程序、开发人员工具(Visual Studio 、SQLServer等等)、系统镜像、设计人员工具等。总的来说,这两个都是非常优秀的Windows系统镜像资源站,提供了丰富的Windows系统镜像资源,并且保证了资源的纯净和安全性,有需要的朋友可以去了解一下。这个非常实用的资源网站的创建者是国内的一个网友。_msdn我告诉你

vue2封装对话框el-dialog组件_<el-dialog 封装成组件 vue2-程序员宅基地

文章浏览阅读1.2k次。vue2封装对话框el-dialog组件_

MFC 文本框换行_c++ mfc同一框内输入二行怎么换行-程序员宅基地

文章浏览阅读4.7k次,点赞5次,收藏6次。MFC 文本框换行 标签: it mfc 文本框1.将Multiline属性设置为True2.换行是使用"\r\n" (宽字符串为L"\r\n")3.如果需要编辑并且按Enter键换行,还要将 Want Return 设置为 True4.如果需要垂直滚动条的话将Vertical Scroll属性设置为True,需要水平滚动条的话将Horizontal Scroll属性设_c++ mfc同一框内输入二行怎么换行

redis-desktop-manager无法连接redis-server的解决方法_redis-server doesn't support auth command or ismis-程序员宅基地

文章浏览阅读832次。检查Linux是否是否开启所需端口,默认为6379,若未打开,将其开启:以root用户执行iptables -I INPUT -p tcp --dport 6379 -j ACCEPT如果还是未能解决,修改redis.conf,修改主机地址:bind 192.168.85.**;然后使用该配置文件,重新启动Redis服务./redis-server redis.conf..._redis-server doesn't support auth command or ismisconfigured. try

实验四 数据选择器及其应用-程序员宅基地

文章浏览阅读4.9k次。济大数电实验报告_数据选择器及其应用

随便推点

灰色预测模型matlab_MATLAB实战|基于灰色预测河南省社会消费品零售总额预测-程序员宅基地

文章浏览阅读236次。1研究内容消费在生产中占据十分重要的地位,是生产的最终目的和动力,是保持省内经济稳定快速发展的核心要素。预测河南省社会消费品零售总额,是进行宏观经济调控和消费体制改变创新的基础,是河南省内人民对美好的全面和谐社会的追求的要求,保持河南省经济稳定和可持续发展具有重要意义。本文建立灰色预测模型,利用MATLAB软件,预测出2019年~2023年河南省社会消费品零售总额预测值分别为21881...._灰色预测模型用什么软件

log4qt-程序员宅基地

文章浏览阅读1.2k次。12.4-在Qt中使用Log4Qt输出Log文件,看这一篇就足够了一、为啥要使用第三方Log库,而不用平台自带的Log库二、Log4j系列库的功能介绍与基本概念三、Log4Qt库的基本介绍四、将Log4qt组装成为一个单独模块五、使用配置文件的方式配置Log4Qt六、使用代码的方式配置Log4Qt七、在Qt工程中引入Log4Qt库模块的方法八、获取示例中的源代码一、为啥要使用第三方Log库,而不用平台自带的Log库首先要说明的是,在平时开发和调试中开发平台自带的“打印输出”已经足够了。但_log4qt

100种思维模型之全局观思维模型-67_计算机中对于全局观的-程序员宅基地

文章浏览阅读786次。全局观思维模型,一个教我们由点到线,由线到面,再由面到体,不断的放大格局去思考问题的思维模型。_计算机中对于全局观的

线程间控制之CountDownLatch和CyclicBarrier使用介绍_countdownluach于cyclicbarrier的用法-程序员宅基地

文章浏览阅读330次。一、CountDownLatch介绍CountDownLatch采用减法计算;是一个同步辅助工具类和CyclicBarrier类功能类似,允许一个或多个线程等待,直到在其他线程中执行的一组操作完成。二、CountDownLatch俩种应用场景: 场景一:所有线程在等待开始信号(startSignal.await()),主流程发出开始信号通知,既执行startSignal.countDown()方法后;所有线程才开始执行;每个线程执行完发出做完信号,既执行do..._countdownluach于cyclicbarrier的用法

自动化监控系统Prometheus&Grafana_-自动化监控系统prometheus&grafana实战-程序员宅基地

文章浏览阅读508次。Prometheus 算是一个全能型选手,原生支持容器监控,当然监控传统应用也不是吃干饭的,所以就是容器和非容器他都支持,所有的监控系统都具备这个流程,_-自动化监控系统prometheus&grafana实战

React 组件封装之 Search 搜索_react search-程序员宅基地

文章浏览阅读4.7k次。输入关键字,可以通过键盘的搜索按钮完成搜索功能。_react search