在RStudio里面部署Python_μμ豆奶的博客-程序员秘密_rstudio安装python

技术标签: python  个人随笔  

2022.8.30 星期二

在过一天就正式步入研三了,感觉一只脚已经踏出了学校,瞬间感觉之前荒废了好多时间,现在最后不到一年的时间更要一天当两天过了,抓着尾巴,再多学一点是一点,今天早上一下地就是一早上,中午再睡个午觉,迷迷糊糊一会就三点多了,真的时间过的超级快,感觉我就看了会学习资料就快11点了,还想着去跑跑步,仿佛时间有点不允许,生信一个小时的课被我反复看,加操作确实需要大量时间,唉,时间都去哪了,有的时候会迷茫,但是不应该一直迷茫,走出来继续奔跑,那才是你应该实施的与信仰的!

今日份代码

今天对shell语法没怎么看,主要是在想之前内容,前面好多有点忘记,导致后面的内容看起来有点吃力。
今天尝试着把Python还有linux与R全部实现在RStudio上面来操作,结果发现R版本过高。。。。又得想办法。大体思路如下:
1.在R里面直接下载reticulate包来做桥接。

install.packares("reticulate")
reticulate::py_config() #调用函数查看Python安装路径

使用usethis包来配置路径

install.packages("usethis")
usethis::edit_r_environ()

加入你自己Python的安装路径

RETICULATE_PYTHIN = "你的Python安装路径"

注意分割符,不要写成转译符。配置好后就可以直接在RStudio里面使用Python啦。

reticulate::repl_python()

这样做生物信息的三个语言就可以融合在一个解释器里面啦!

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