由于作者的研究方向是生物信息学,经常需要对一些生物分子进行操作,需要一个可视化的操作软件,这个软件就是PyMOL
。但是最近在安装PyMOL时出现了不少问题,而且很多问题在网上搜索都是没有办法解决的,所以想写一个教程帮助一下有需要的人。
PyMOL
是一个开放源码,由用户赞助的分子三维结构显示软件。PyMOL
适用于创作高质量的小分子或是生物大分子(特别是蛋白质)的三维结构图像。
Ubuntu
自带的apt
进行安装。命令是sudo apt install pymol
,安装完成之后,运行pymol
出现下面的问题。conda
进行安装。命令是conda install -c conda-forge -c schrodinger pymol-bundle
,安装完成之后,运行出现了新的问题。Ubuntu
上安装软件的方式,作者决定直接从源码安装,做最后的尝试。从源码安装的教程在PyMOL的Wiki上已经给出来了,直接点击该链接就可以看到啦!我之前已经安装过好几次PyMOL
了,在Windows
和MacOS
上都是直接安装成功了。主要还是因为之前的安装都是从官网上直接下载安装包,一键傻瓜式安装。这次的安装遇到的这些问题,其实并没有解决,所以如果有知道解决办法的朋友,可以直接联系我,我也想弄清楚因为什么。
PyMOL
的维基百科:https://zh.wikipedia.org/wiki/PyMOL
PyMOL
教程:https://pymolwiki.org/index.php/Main_Page
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