riboPOOL—适合任意物种(真核生物、原核生物、高丰度mRNA)的核糖体RNA/rRNA去除方案(探针法)siTOOLs Biotech中国总代理蓝景科信_rrna探针捕获 生物素-程序员宅基地

技术标签: ribosomal profiling  RNA-seq  

RNA测序是一种高度准确且灵敏的转录组追踪工具。然而,一些丰度很高的RNA种类却影响了NGS文库制备,浪费了宝贵的测序资源。在提取到的总RNA中,核糖体RNA(rRNA)占95%左右,mRNA占2-3%,还有2-3%是非编码RNA,如Long non-coding RNA、tRNA、microRNA等。
所以,在RNA测序的过程当中,首先要解决的问题,是如何去除核糖体RNA(rRNA)。

riboPOOL是来自德国siTOOLs Biotech的核糖体RNA去除产品,能够高效去除与研究无关的RNA,让研究人员更高效地利用测序资源。
riboPOOL核糖体RNA去除方案,适合任意物种,去除效率高且效果稳定,广泛应用于RNA-seq、芯片、ribo-seq(ribosome profiling)等领域,在欧洲广受好评。
riboPOOL由精心设计的生物素标记的DNA探针混合物构成,保证RNA完整的前提下,比Ribo-Zero(Illumina)多去除约10%的rRNA。

蓝景科信是siTOOLs Biotech在中国的总代理,联系方式:15632249798,QQ:2522026793

riboPOOL主要优势
1、任意物种
去除任意物种的rRNA或高丰度mRNA:丰富的成品型目录可供选择,目录持续更新中;目录以外的物种的rRNA,或者组织特异性的高丰度mRNA均可定制。
在这里插入图片描述
2、去除不依赖poly-A结构
适合非Ploy-A化的RNA(如snoRNA、lncRNA、组蛋白)的研究和原核生物。
3、广泛的起始量范围
在100 ng到5 μg的RNA起始量之间都有很好的去除效率。

ribPOOL特殊应用
1、原核通用型riboPOOL与环境基因组学
原核通用型不仅可以广泛应用于各种原核生物样本(细菌、古生菌),还可以处理含有不同微生物的复杂样本,如环境基因组样本(如土壤、污泥)。
2、去除高丰度RNA
除rRNA之外, riboPOOL还可以去除组织特异性mRNA(如人血珠蛋白)或其他测序时出现的不相关的高丰度RNA。
3、可应用于Ribosome profiling
riboPOOLs 可以应用于ribosome profiling样本,更多信息,请联系我们。
4、复合型riboPOOL可以去除混合样本中的rRNA
复合型riboPOOL可以去除含多个物种的混合样本中的rRNA。客户可根据样本的组成比例混合2-4种成品型riboPOOL使用,如病原体感染的人体组织(人源+原核通用型)、人血液样本(人源+人血珠蛋白)。

实验流程
在这里插入图片描述
实验数据
在这里插入图片描述
人类样本中,riboPOOL的去除效率是98.6%,而Comp Z的去除效率是80.6%。
小鼠样本中,riboPOOL的去除效率是96.4%,而Comp Z的去除效率是86.1%。

2013年,siTOOLs Biotech公司由RNA领域的专家在慕尼黑和雷根斯堡成立,团队涵盖RNAi筛选、RNA生产和生物信息学等方面具有长期经验的科学家,产品在欧洲得到研究院校和制药企业的广泛认可。siTOOLs Biotech在中国的总代理是蓝景科信。

siTOOLs Biotech主要产品线:
siPOOL—基因沉默工具(siRNA)
raPOOL—RNA捕获工具,RNA亲和纯化探针
riboPOOL—核糖体RNA去除工具
实验结果稳定可重复,为您节约时间和成本。我们还提供先进的大数据分析工具(Phenovault)和研究服务,助力临床前研究中的靶点发现和验证。
在这里插入图片描述
核心技术

科学设计、集群效应,保证高效特异的作用于靶基因。
类似狼群所展示的群体智慧,我们利用集群的力量来实现具有挑战性的目标。基于此理念,我们科学优化设计siRNAs或生物素化探针混合物,并反复被证明可以显著减少脱靶效应,实验效率高,结果可靠且可重复。

核心文献:
Hannus, M., et al.(2014) siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049‒8061.
联系方式:15632249798
QQ:2522026793
详情可见:http://www.bluescape.cc/index.php/Index/chanpin.html?pin_id=21&fc_id1=&fc_id2=&fc_id3=

版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接:https://blog.csdn.net/Bluescape/article/details/107180952

智能推荐

Oracle 数据库迁移-程序员宅基地

文章浏览阅读1.7k次,点赞3次,收藏14次。一、创建用户1.1 步骤1.2 注意事项二、处理空表(1)描述Oracle11g中的新特性,当一个表中的数据为0时不分配segment,所以就不能够被导出。(2)解决方法方法一:先insert一条数据,再rollback就产生segment了,该方法是在空表中先插入一条数据,再删除就 产生segment了,执行exp或者expdp时就可以导出了此空表了。方法二:修改 deferred_segment_creation 参数,该参数默认为TRUE,当修改为F..

【建议收藏】16个OpenCV函数开始你的计算机视觉之旅_opencv算法实现-程序员宅基地

文章浏览阅读2.3k次,点赞4次,收藏37次。计算机视觉是当前行业中比较热门的领域之一。由于技术和研究的飞速发展,它正在蓬勃发展。但这对于新来者来说仍是个艰巨的任务。XR开发者或数据科学家在过渡到计算机视觉时面临着一些常见的挑战,包括:1.我们如何清理图像数据集?图像有不同的形状和大小2.数据获取中一直存在的问题。在建立计算机视觉模型之前,我们应该收集更多图像吗?3.学习深度学习对建立计算机视觉模型是否必不可少?我们可以不使用机器..._opencv算法实现

MySQL8.0以上授权远程连接时,必须创建新用户_mysql8一定要建用户组吗-程序员宅基地

文章浏览阅读214次。#进入mysqlmysql –uroot -p#给指定ip赋权限GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'ldq'@'172.69.7.251' WITH GRANT OPTION;#修改密码ALTER USER 'ldq'@'172.69.7.251' IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY 'ldq2021';flush privileges;exit;MySQL8在实现远程连接(如远程phpmyadmin访问数据库服务器_mysql8一定要建用户组吗

python3 更新和删除 elasticsearch 及其删除es索引_删除requstes-程序员宅基地

文章浏览阅读8.3k次。from elasticsearch import Elasticsearches_client = Elasticsearch(["localhost:9200"])// 多个条件限制的删除delete_options ={"query":{ "bool":{ "must":[{"te..._删除requstes

QNX 分区和文件系统制作_qnx 文件系统测试-程序员宅基地

文章浏览阅读544次。QNX 分区和文件系统制作_qnx 文件系统测试

《七天数据可视化之旅》第一天 数据可视化过程-程序员宅基地

文章浏览阅读236次。《七天数据可视化之旅》第一天 数据可视化过程Destiny,某物流公司数据产品经理,目前从事数据平台搭建和可视化相关的工作。持续学习中,期望与大家多多交流数据相关的技术和实际应用,共同成长。0x00 前言之前写过一篇文章,叫做数据可视化的基本流程,是站在可视化过程中的上下游关系,来梳理和介绍数据可视化的全过程,及其各个环节的主要工作内容。今天这篇文章,也是介绍数据可视化的过程,但是更多的是站在产品..._可视化工具的一天

随便推点

[Android]为Spinner填充数据后设置默认值的问题_android spinner 为什么默认第一条-程序员宅基地

文章浏览阅读135次。前言   为Spinner适配完数据后需要设置其默认选项,但是发现直接setSelection(int position)有时候不管用,打开选项又发现已经选中了,但是显示出来的选项又始终默认第一个_android spinner 为什么默认第一条

Python入门-程序员宅基地

文章浏览阅读7.4k次,点赞61次,收藏223次。Python入门目录1.Python基本数据类型 2.Python的print语句 3.Python的注释 4.Python的变量 5.Python中raw字符串与多行字符串 6.Python当中的Unicode字符串 7.Python中的整数和浮点数 8.Python中的布尔类型 9.Python中的List 10.Python中的tuple 11.Python中的条件判断和循_python入门

uni-app中实现动态导航栏_uniapp动态渲染的横向导航栏-程序员宅基地

文章浏览阅读1.5k次。原理:同一页面的两处跳到同一页面,通过路由携带导航标题参数和uni-app中自定义导航栏API–uni.setNavigationBarTitle实现index.vue<template> <view @click="toSearch('搜索')"></view> <view @click="toSearch('全部')"></view></template><script> export default {_uniapp动态渲染的横向导航栏

基于语义分割实现人脸图像的皱纹检测定位与分割_机器视觉识别面部皱纹-程序员宅基地

文章浏览阅读2.8k次,点赞7次,收藏42次。详细记录基于深度学习算法enet的人脸皱纹检测与定位,从数据收集、标注、处理、到模型训练模型部署。_机器视觉识别面部皱纹

Unity鼠标控制物体 拖动旋转-程序员宅基地

文章浏览阅读6.6k次。public class Script2 : MonoBehaviour{ Ray ray; RaycastHit hit; GameObject Obj; Vector3 _Obj屏幕坐标_; Vector3 _鼠标世界坐标_; Vector3 _Obj坐标差值_; float _水平旋转_; float _垂直旋转_; ...

华为手机linux连接网络设置ip地址,华为路由器(Huawei)默认登录IP地址是多少-程序员宅基地

文章浏览阅读542次。本站收集了华为路由器所有的登录地址;路由器登录地址可以登录到路由器的管理界面,然后设置路由器各项参数,如果你使用的是华为路由器,请在以下列表中找到路由器的登录地址。华为IP地址列表10.0.0.13810.0.0.210.0.20.1192.168.0.1192.168.1.1192.168.1.254192.168.100.1192.168.15.1192.168.2.1192.168.254...._华为路由器 linux 访问

推荐文章

热门文章

相关标签